আকারে, জেলাটি উত্তর-পশ্চিমের দিকে ইঙ্গিত করে একটি আইসোসিল ত্রিভুজটির সদৃশ। মুর্শিদাবাদ পশ্চিমবঙ্গের মাঝামাঝি অবস্থিত, বহরমপুরের সদর দফতরের সাথে ২৩º৪৩’এন এবং ২৪º৫২’এন অক্ষাংশ এবং ৮৭º৪৯’ই এবং ৮৮º৪৪’ই দ্রাঘিমাংশের মধ্যে অবস্থিত ।
এটির আয়তন সর্বমোট ৫৩১৬.১১ বর্গ কি.মি. পদ্মা নদী পুরো পূর্ব সীমানা দিয়ে প্রবাহিত হয়েছে, জেলাটিকে মালদা ও রাজশাহী (বাংলাদেশ) জেলা থেকে পৃথক করেছে। বর্ধমান ও নাদিয়া দক্ষিণে এবং বীরভূম এবং পাকুর (ঝাড়খণ্ড) জেলার পশ্চিমে রয়েছে। মূল ভাগীরথী নদীটি পূর্বদিকে ‘বিগ্রি’ এবং পশ্চিমে ‘আরএআরএইচ’ নামে দুটি অংশে জেলাটিকে বিভক্ত করেছে। জেলাটির একটি আন্তর্জাতিক সীমানা রয়েছে যার দৈর্ঘ্য ১২৫.৩৫ কিলোমিটার যার মধ্যে ৪২.৩৫ কিলোমিটার জমিতে রয়েছে এবং বাকী ১১ টি ব্লক ধরে নদী প্রবাহিত রয়েছে। মুর্শিদাবাদে ২৫৪ টি গ্রাম পঞ্চায়েত, ২৬ টি ব্লক, ২৮ টি থানা ৫ টি মহকুমা এবং ৮ টি পৌরসভা রয়েছে।